社會背景與成立緣由
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根據搜索自「聯合知識庫」的歷年新聞，自
民國83年（1994）起，台電便積極尋找核廢料的存放場址，
民國85年（1996），台電以30億元徵求願參加核廢料最終處置場場址徵選的地方，澎湖縣
望安鄉東吉嶼名列其中，11月9日，
望安鄉民代表會通過同意參加徵選，然卻引起澎湖旅台人士不滿，並集會反對，11月17日，旅台人士於高雄市成立「澎湖縣
望安鄉東吉村反核廢料保鄉自救會」，宣誓反對於
東吉嶼設立核廢料處置場，11月22日，
東吉村民組成船隊，冒著強風返回
望安，到鄉公所表達強烈抗爭，12月8日，自救會至
望安島舉辦說明會並連署欲罷免時任鄉長許龍富，嗣後
望安鄉遂撤回同意書，12月31日，台電公布合格候選場址，
東吉嶼並未進入評選。
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民國86年（1997）6月，行政院原子能委員會要求由徵選改為徵選與評選並行，於是
東吉嶼復列入台電溝通對象。
民國87年（1998）2月23日，金門縣烏坵鄉被評選為核廢料最終處置場最佳地點，依次為台東縣達仁鄉與小蘭嶼，其後地方反彈，聲浪不息。時至
民國91年（2002），又有傳聞台電評估澎湖
東吉嶼、基隆彭佳嶼、台東蘭嶼為可行性較佳場址。3月1日，台電選出蘭嶼以及彭佳嶼作為烏坵小坵的優先替代場址。同月，環保署範疇會議通過以金門縣烏坵鄉為最終處置場，澎湖縣
望安鄉東吉嶼、基隆市彭佳嶼、台東縣蘭嶼為三處替代場址。8月，由於受挫頗鉅，台電決定中止於金門縣烏坵鄉小坵島興建低放射性核廢料最終處置場的計畫。
民國92年（2003），時任總統陳水扁承諾不將核廢料置於
東吉嶼。
民國94年（2005）3月11日，台電欲至
東吉嶼進行評估作業，遭逢島民極力阻擋，5月15日，澎湖旅台人士於高雄縣舉行反核廢料、救
東吉（東吉嶼 東吉村）、救澎湖大會師，表達反核廢進駐立場。
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民國95年（2006）5月24日，「低放射性廢棄物最終處置設施場址設置條例」頒布，選址條例的主管機關為行政院原子能委員會，主辦機關為經濟部，同年，經濟部於8月23日組成場址選擇小組，並於
民國96年（2007）3月21日公告選址計畫。9月19日，16
澎湖縣政府農漁局進行公開招標，嗣後委託中華民國永續發展學會施行「
玄武岩保留區（
東吉嶼、
西吉嶼、頭巾、
鐵砧）基礎調查與經營管理可行性評估」一案。
民國97年（2008），農漁局動作頻仍，2月21日於高雄縣鳳山市
啟明宮舉辦說明會，4月16日上午於
望安鄉公所舉辦說明會，4月16日下午於
東吉國小舉辦說明會，並曾分別於2月15日以及4月16日邀集專家學者進行工作會議，8月，農漁局成立自然地景審議委員會，與此同時，經濟部於8月19日票選出三個潛在場址，8月29日進行公告，分別為台東縣達仁鄉、屏東縣牡丹鄉、澎湖縣
望安鄉。9月21日，農漁局邀請機關代表與專家學者進行現勘與審議，並邀集所有權人、使用人、管理人出席表達意見，出席委員12員，1員有條件通過，其餘一致通過劃設自然保留區。
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鑑於上述，
澎湖縣政府於
民國97年（2008）9月23日依「文化資產保存法」第79條以及「自然地景指定及廢止辦法」第2、3條，公告劃設
東吉嶼、
西吉嶼、頭巾、
鐵砧為「澎湖南海
玄武岩自然保留區（
東吉嶼、
西吉嶼、頭巾、
鐵砧）」，範圍包含頭巾頭巾段1、2、3、4、5等五筆地號及平均高潮位以上之全部土地（0.7741公頃）、
鐵砧鐵砧段1、2、3等三筆地號及平均高潮位以上之全部土地（1.2372公頃）、
西吉嶼西吉（西吉嶼 西吉村）段1、1-1、1-2、49、71等五筆公有土地（39.9970公頃）、
東吉嶼東吉（東吉嶼 東吉村）段1地號等160筆公有土地（40.2906公頃）。其指定理由有三：1）具有代表性生態體系；2）具有獨特地形、
地質意義；3）具有基因保存永久觀察、教育研究價值之區域。此自然保留區美其名係為保護
玄武岩地景，惟劃設時機敏感，一般認為主要用意在於封鎖台電核廢料進駐
東吉嶼。
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饒是如此，核廢選址小組於
民國98年（2009）2月20日依據評量成果，選擇台東縣達仁鄉與澎湖縣
望安鄉為建議候選場址，經濟部並於3月17日至4月16日上網及公開「建議候選場址遴選報告」。而
澎湖縣政府隨即於3月20日決定擴大保留區範圍，此外，島民也未雨綢繆，4月11日於鳳山市
啟明宮成立「反核廢料自救會」。
民國98年9月15日，
澎湖縣政府公告修正擴大保留區範圍，19添增
東吉嶼東吉（東吉嶼 東吉村）段2地號等1245筆土地（93.9555公頃），加上原本劃設之公有土地，共計1405筆土地（134.2461公頃），而整個保留區面積更達176.2544公頃（如圖1-5-2）。時至
2011年，經濟部證實已將
東吉嶼排除於核廢料掩埋場選址地點之外。綜觀上述，核廢一事使得
東吉嶼島民、甚至是澎湖居民的凝聚力因而強化，保留區催生乃係眾望所歸，地方機關及民間意識有志一同，遑論有反對之舉，而此保留區更是臺灣首度由
縣政府申請提報的自然保留區，頗具歷史意義。
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文字引用｜
望安鄉志（上冊）
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經營管理方面，澎湖南海
玄武岩自然保留區的執掌者為
澎湖縣政府農漁局生態保育科，相關管制事項有四，包含一般管制事項、特別管制事項、承載量管制以及其他管制事項，一般管制事項係指「自然保留區禁止改變或破壞其原有自然狀態。為維護自然保留區之原有自然狀態，非經主管機關許可，不得任意進入其區域範圍」，特別管制事項容許其他利用，分別為：1）每年11月至翌年3月紫菜生長期間，漁民得登岸採收紫菜，但不得違反本保留區保護利用管制事項；2）島上居民耕作、放牧牛羊及漁獵在不破壞自然地貌的前提，得允許施作；3）特許外來民眾在
西吉嶼、
東吉嶼保留區內規劃動線上行走。島上居民及擁有土地、地上物所有權人可自由進出；4）保留區內既有設施、建築物、道路及其它公共設施，得以修繕、維護。至於承載量管制則係指「保留區僅供學術研究或教育目的、宣導提出申請進入，
頭巾嶼、
鐵砧每日以30人為限，
東吉嶼、
西吉嶼每日以100人為限」。其他管制事項為「其他依野生動物保育法、文化資產保存法及漁業法等之規定事項」。
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經營管理與相關研究
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整體而言，由於此自然保留區實為阻擋核廢料進駐所劃設，故實際經營管理著力較少，僅以離島建設基金為經費來源，雇員巡守維護，相形之下，反倒是宣示非核家園的意味較為濃厚。深究其實，乃因四個島嶼位處澎湖南海邊陲，而農漁局生態保育科總轄數個自然保護區（分別為澎湖
玄武岩自然保留區、澎湖南海
玄武岩自然保留區、澎湖縣
貓嶼海鳥保護區、澎湖縣
望安島綠蠵龜產卵棲地保護區），人力資源堪屬匱乏，常因鞭長莫及而顯得有心無力。至於週遭海域雖非保留區範疇，惟迭有漁民非法電、毒、炸魚，亦有大陸漁民越界等情事，此為其主要隱憂。
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截至目前，針對澎湖南海
玄武岩自然保留區的相關研究僅有數篇，較屬闕如，例如《
澎南四島及澎湖保護區經營探討管理分析》一文，主要係探討欲成立的
南方四島海洋國家公園，針對澎湖各個現存保護區包含自然保留區，僅止於表面描述，並未深究。另文則進行空缺分析（Gap Analysis）研究，並指出此保留區的數項空缺，包含指標物種空缺、環境保育空缺、經營管理空缺、海防危機空缺。至於針對此保留區進行檢討的研究計畫則指出其壓力威脅所在，計有12項，涵括：1）核廢料掩埋預定地的土地開發壓力與放射線汙染威脅；2）位置遙遠，交通往來時間長，經營管理與執法鞭長莫及；3）
羊群對
東吉嶼、
西吉嶼的生物衝擊；4）違法捕魚（電魚、毒魚、炸魚）在部分地區頻仍；5）中國漁船入侵海域，捕捉動物資源（不當漁法、過漁、珊瑚等）；6）海洋垃圾與廢棄物量多，汙染海岸及
潮間帶；7）遊憩壓力為釣客及部分旅遊業者帶團上島至保留區內活動；8）針對保育目標「具有代表性生態體系」的具體內容尚且資料不足；9）南海四島海域的棘冠海星大爆發；10）經營管理人力不足；11）現場工作人員不足；12）行政管理工具未健全。除前述外，由於此保留區尚未擬具保育計畫書，故整體經營管理未臻健全。
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文字引用｜望安鄉志（上冊）
知識建檔｜2017-11-11。知識更新｜2026-08-15
