清國與日本在
光緒20年（1894）爆發「甲午戰爭」，次年
（1895）雙方於日本的馬關媾和換約，戰敗的清國於和約中將臺灣、澎湖割讓予日本。在殖民臺灣、澎湖期間，為維護社會治安及協助政務、政策的推行，日本當局乃引入近代的警察制度，是為地方行政的重心之一。
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明治28年（1895）5月，首任臺灣總督樺山資紀奉命接收臺灣，在渡海時於船上即頒布「臺灣總督府假條例」（臺灣總督府臨時條例）；條例中的第十五條明訂在內務部轄下設有警保課，負責警察、監獄相關事項。同年6月17日，於台北城內舉行始政之式典，時任命千千岩英一為內務部警保課長心得（代理課長）；千千岩英二隨於20日提出在臺設置警察的建議。同年6月28日，總督頒布了最初的「地方官假官制」（地方官臨時官制），劃分臺灣行政區域為臺北、臺灣、臺南3縣及
澎湖島廳。在
澎湖島廳內設置了警察署、監獄署及島廳醫，警察署下再分設警察分署，此為澎湖警察制度之肇始。
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不過在領臺初期，臺灣中南部地區的亂事未定，故於
明治28年（1895）8月6日時頒布「臺灣總督府條例」，在總督之下設參謀長，以軍政取代當初的民政措施；而先前的「臺灣總督府假條例」（臺灣總督府臨時條例）及「地方官假官制」（地方官臨時官制）則暫停實施，並改臺灣、台南縣為民政支部。不過臺北縣與
澎湖島廳之情勢已大致抵定，故仍維持舊制（臺灣總督府警務局1933a：15-21）。
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日治時期澎湖警察制度的沿革，主要仍跟隨行政區域的變更與政策的推行有著密切的關係，以下將針對其制度的改變，以澎湖廳（郡）下轄之地方警察機構的改稱為分期進行說明。
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壹、警察署時代（1895～
1898年）
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臺灣的行政體制在全島亂事平定之後再度回歸民政，
明治29年（1896）3月時發布敕令第91號「臺灣總督府地方官官制」，再次劃分全臺為臺北縣、臺中縣、臺南縣及澎湖廳。同年5月發布訓令5號「地方廳分課規程標準」，做為地方行政組織的依據。澎湖廳遂於廳內置內務課、財務課及警察課；警察課內分設警務係、保安係、衛生係及高等警察主任。廳下轄有澎湖警察署，依循值勤地區再分設澎湖水上分署、
漁翁島分署、
隘門分署、
白沙島分署及
八罩島分署。
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明治30年（1897）5月，為擴充臺灣基層行政機構，又發布了敕令第152號，增加新竹縣、嘉義縣、鳳山縣及宜蘭廳、台東廳等，時全臺共計有六縣三廳。隨著本次的官制改正，澎湖警察署的層級、名稱亦有所調整，廳下改轄
媽宮警察署、
隘門警察署、
小池角（池東村 池西村）警察署、
大赤崁警察署及網垵警察署。
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貳、出張所時代（1898～
1901年）
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明治31年（1898）6月，為簡化及統合地方行政系統，發布了敕令第108號進行官制改正，縮減六縣三廳為臺北、臺中、臺南三縣及宜蘭、臺東、澎湖三廳；同時將原來各地的警察署、撫墾署併入辦務署內。辨務署的組織包括三課，分別職掌一般行政事物、警察事務及蕃人蕃地相關事務；此外，在辦務署轄下可設立辦務支署，由警部、警部補及巡查組成，負責管理「警察官吏派出所」，藉以建立更為周全密集的基層警察網絡（
吳南茜1999：22）。但在此波行政組織的革新中，澎湖廳將辨務署改為廳直轄，而設
隘門、
小池角（池東村 池西村）、
大赤崁及網垵等出張所，同年12月再增
媽宮出張所（
李紹章1960：89）；而各出張所下再設置警察派出所。
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參、支廳時代（1901～
1945年）
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及至
明治34年（1901）11月，在當時民政局長後藤新平的主導下，廢止三縣四廳制，並公布敕令第202號進行地方制度改革，重劃臺灣的行政區域為臺北、基隆、宜蘭、深坑、桃仔園、新竹、苗栗、臺中、彰化、南投、斗六、嘉義、鹽水港、臺南、
蕃薯蓑、鳳山、阿猴、恆春、臺東及澎湖等二十廳。由原先總督府、縣（廳）、辨務署的三級制，簡化為總督府與廳的二級制。除照舊制於廳內置警務課外，自此廳長之職皆由總督府以具有警視階級及身分者派任，且廳下所設支廳之支廳長、課員也幾乎都由警察擔任，業務也以警察的工作為主；整個地方官官制成為一有別於民政的警政系統，警察成為殖民統治重要的工具（
吳南茜1999：21-34）。自此，澎湖廳下設
小池角（池東村 池西村）、
大赤崁及網垵三支廳，支廳下置派出所；廳內則置警務課，下分警務、保安、衛生及高等警察等四係（
李紹章1960：164）。
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明治42年（1909）10月雖再次發布令，將二十廳合併為十二廳，並以區域大小、治理難易為考量，劃定澎湖廳的層級為三等廳，但基本上其警政之組織架構未有太大的變化。惟澎湖廳下於
大正2年（1913）6月、
大正4年（1915）陸續裁撒
大赤崁支廳及
小池角（池東村 池西村）支廳。
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大正8年（1919）8月，首任文官出身的臺灣總督田健治郎就任，在抱持同化政策的概念，及考量都會集中主義發展下造成的城鄉差距，其於翌年
（1920）6月發布敕令第218號，將施行的十二廳制改為臺北、新竹、臺中、臺南、高雄五州及臺東、花蓮二廳。州下設郡、市，其下再設街、庄；而廳下則設支廳，其下再設街、區（臺灣總督府警務局1933a：612-616）。新實施的街庄制改變以往的中央集權而擴張地方權限，且一改以警察任職多數地方官更的情形，將行政事務劃歸一般文官負責。澎湖在本次地方行政組織的改革中改廳為郡，隸屬於高雄州轄；郡役所內置庶務、警察二課，在
望安另設有警察課分室，時全澎計有警察官更派出所21處。
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大正.15年
（1926）6月發布敕令第180號，澎湖廢郡升格為廳。依循新制廳內置警務課，課內分為警務、保安、衛生及高等警察四係；另廳下恢復
馬公、
望安二支廳，總計轄有警察官更派出所22處。
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文字引用｜澎湖縣歷史建築馬公水上警察官吏派出所調查研究計畫
知識建檔｜2026-07-16
