公共衛生為保障環境與健康的要素，偏重預防，多透過行政體系之力量執行；醫療為矯正與治療之手段，為事後補救與防止惡化，公、民營醫療院所均肩負責任。不過有時公衛行政體系也從事醫療，醫療機構亦可兼顧公共衛生之執行。澎湖最早的現代衛生醫療機構為
日治時期明治29年（1896）在
媽宮設立的澎湖島醫院（原隸澎湖廳，後改隸臺灣總督府），以及澎湖廳內設置的醫務課、衛生科，傳染病預防為其主要業務。鄉間的衛生醫療事務則另設公醫辦理。
昭和8年（1933），
湖西、
大赤崁（
白沙）、
小池角（
西嶼）、
望安、
大嶼（
七美）、
東吉、
吉貝各設公醫一人，共七人，可說是後來鄉衛生所與離島衛生室的濫觴。
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資訊引用｜《續修澎湖縣志｜衛生志》
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